Stručna služba 

ODJEL STRUČNIH POSLOVA ZAŠTITE, ODRŽAVANJA, OČUVANJA I KORIŠTENJA ZAŠTIĆENIH DIJELOVA PRIRODE I PODRUČJA EKOLOŠKE MREŽE (skraćeno: Stručna služba)

Stručni poslovi nose funkciju javne ustanove tj. to su poslovi koji direktno doprinose ispunjavanju zakonske nadležnosti i svrhe osnivanja javne ustanove koja upravljanja zaštićenim dijelovima prirode (zaštićenim područjima, zaštićenim vrstama i zaštićenim mineralima i fosilima) te područjima ekološke mreže u Međimurskoj županiji.

Odjel stručnih poslova zaštite, održavanja, očuvanja i održivog korištenja zaštićenih dijelova prirode i područja ekološke mreže obavlja stručne poslove, a aktivnosti se odnose na:
A. Očuvanje prirodnih vrijednosti (praćenje stanja, koordinaciju i provedbu istraživanja sastavnica prirode, provođenje aktivnih mjera zaštite, nadzor područja i sl.) 
B. Održivo korištenje prirodnih dobara (poticanje pozitivnih oblika korištenja prostora)
C. Zaštitu i očuvanje kulturne baštine i tradicijskih vrijednosti (poticanje na zaštitu materijalne i nematerijalne baštine koja je u vezi s zaštićenim područjima)
D. Upravljanje posjećivanjem, interpretaciju i edukaciju (održivi razvoj posjećivanja, razvoj posjetiteljske infrastrukture i edukativnih programa, kreiranje informativnih i edukativnih materijala, promocija i podizanje javne svijesti)
E. Suradnju s lokalnom zajednicom (poticanje lokalne zajednice na projekte u zaštiti prirode, pružanje savjetodavne podrške, zajednička provedba aktivnosti s lokalnom zajednicom i sl.) F. Razvoj kapaciteta Ustanove.

Unutar Odjela postoje 2 odsjeka:
2.A. Odsjek neposrednog nadzora (skraćeno: Služba čuvara prirode)
2.B. Odsjek za upravljanje projektima (skraćeno: Projektni poslovi).